A mezofil típus után a második legnépszerűbb és leggyakrabban használt starterkultúra a termofil baktériumok. Számos használati és gyártási jellemzővel rendelkeznek.
A 25-30 Celsius-fokig melegített tejhez adott, gyakoribb mezofil fermentekkel ellentétben a termofil 30-40 fokot és még többet "tolerál". A hőmérsékleti viszonyokra való kisebb érzékenység miatt az utóbbi típusú sajt-összetevők nélkülözhetetlenné válnak az Olaszországban nagyon népszerű, úgynevezett kivonatos sajtok gyártásában, valamint a fajták újramelegítésében. Ide tartoznak a "Mozzarella", a "Provolone", a "Romano" fajták és különféle fajták, amelyeket hagyományosan Svájcban állítanak elő.
A termofil starterek előállításához használt baktériumok fő törzsei a Streptococcus thermophilus, a Lactobacillus delbrueckii ssp. Bulbaricus és a Lactobacillus helveticus. 65 Celsius-fokos hőmérsékleten túlélik és jól érintkeznek a tejjel. Alacsonyabb hőmérsékleten nem kizárt a termofil starterkultúrák keverése a mezafil kultúrákkal.
Ha egyszerű házi sajtot vagy félkemény változatot szeretne készíteni, például a "Gouda" -t, akkor egyszerűen nincs szüksége termofil starterkultúrákra. Ugyanez vonatkozik a különféle penészfajtákra is - fehér, kék, zöld vagy piros-narancs. Ebben az esetben csak rendszeres mezofil starterkultúrát kell vásárolnia.